安徽医科大学前身是上海东南医科大学（1926年创始），1927年学校出版《东南医刊》，1934年与中华民国医药学会会志及社会医报三志合刊发行，定名《新医药》月刊，发起人为陈方之和校董汪企张先生。1955年学校主办医学学术性期刊《安徽医学院院刊》，为内部资料，由院党委书记李广涛同志致发刊词，当年共出版2期。1958年，经安徽省委宣传部批准成立了《安医学报》，定为季刊，由党委书记陈韧同志致发刊词。1981年，经安徽省新闻出版局批准，更名为《安徽医学院学报》季刊。1985年，该刊更名为《安徽医科大学学报》。

2001年学校成立出版中心，负责编辑、管理和指导安徽医科大学各期刊的编辑出版工作，中心由学校直属管理。目前，中心除了编辑出版《安徽医科大学学报》《中国药理学通报》《临床与实验病理学杂志》3种期刊外，还代行管理、指导由学校主管、主办、编辑出版的9种医学学术期刊，均具有CN和ISSN刊号，国内外公开发行。12种期刊中被CSCD收录的核心期刊2种，北大《中文核心期刊要目总览》收录的期刊4种，WJCI收录的核心期刊4种；其中9种期刊被国家科技部中国科技信息研究所收录为统计源期刊，即中国科技核心期刊。

出版中心现有专职编辑10人，其中博士1人，硕士6人；正高级职称3人，副高级职称2人，中级职称3人。出版中心主任夏青（1161846296@qq.com），副主任王劲松。